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GGDB Web Service API マニュアル

1. GGDB Web Serviceとは？

GGDB Web Serviceでは、GGDBのデータを利用することができる様々なAPIを提供しています。

APIを利用することにより外部より簡単にGGDBのデータにアクセスできるので、どなたでもGGDB Web Serviceを利用したアプリケーションの開発が可能になります。

2. どのようなサービスを提供しているのか？

GGDB Web Serviceでは、REST/SOAP方式のAPIを提供しています。

各APIの詳細については後述のAPIマニュアルをご参照ください。

3. どうやって利用するのか？

GGDB Web Serviceでは、REST/SOAP方式のAPIを提供しています。

REST-APIを使用するには、HTTPコネクションを使用できる環境が必要になります。

またブラウザや、Perl、Javaのようなプログラミング言語が必要です。

APIマニュアルにはRESTのサンプルURLやSOAP-APIのサンプルプログラムも記載していますので、ご参照ください。

4. APIマニュアル

searchSymbol
REST Operation	/search/query+symbol[offset,[limit]][/type]
SOAP Operation	searchSymbol
Description	Symbol情報を検索して、エントリ一覧を返す

SOAP

Operation	searchSymbol
WSDL	http://riodb.ibase.aist.go.jp/rcmg/ws/ggdb/services/GGDB?wsdl
WSDL Input	symbol (xs:string), type (xs:string), offset (xs:Integer), limit (xs:Integer)
Input Description	symbol: 検索したいキーワード(symbol) type: list or cnt offset: オフセット値 limit: 取得件数
WSDL Output	return (xs:string)
Output Description	エントリの詳細情報一覧（XML形式）
Sample Code	try { jp.jcggdb.webservice.GGDBStub stub = new jp.jcggdb.webservice.GGDBStub(); jp.jcggdb.webservice.GGDBStub.SearchSymbol req = new jp.jcggdb.webservice.GGDBStub.SearchSymbol(); req.setSymbol("FUT"); req.setType("list"); req.setOffset(0); req.setLimit(5); jp.jcggdb.webservice.GGDBStub.SearchSymbolResponse res = stub.searchSymbol(req); System.out.println(res.get_return()); } catch (Throwable e) { e.printStackTrace(); }

REST

Operation	search
URI Convention	/search/query+symbol[offset,[limit]][/type]
Input	query, type, offset, limit
Input Description	query: 検索したいキーワード (Symbol) type: list or cnt offset: オフセット値 limit: 取得件数
Output	xml
Output Description	エントリの詳細情報一覧（XML形式）
Sample URI	http://riodb.ibase.aist.go.jp/rcmg/ws/ggdb/search/FUT11+symbol/ http://riodb.ibase.aist.go.jp/rcmg/ws/ggdb/search/FUT11+symbol/list http://riodb.ibase.aist.go.jp/rcmg/ws/ggdb/search/FUT11+symbol/cnt http://riodb.ibase.aist.go.jp/rcmg/ws/ggdb/search/FUT11+symbol/1,5 http://riodb.ibase.aist.go.jp/rcmg/ws/ggdb/search/FUT11+symbol/1 http://riodb.ibase.aist.go.jp/rcmg/ws/ggdb/search/FUT11+symbol/1,5/list http://riodb.ibase.aist.go.jp/rcmg/ws/ggdb/search/FUT11+symbol/1,5/cnt

searchDesignation
REST Operation	/search/query+designation[offset,[limit]][/type]
SOAP Operation	searchDesignation
Description	Designation情報を検索して、エントリ一覧を返す

SOAP

Operation	searchDesignation
WSDL	http://riodb.ibase.aist.go.jp/rcmg/ws/ggdb/services/GGDB?wsdl
WSDL Input	enzyme (xs:string), type (xs:string), offset (xs:Integer), limit (xs:Integer)
Input Description	enzyme: 検索したいキーワード(enzyme) type: list or cnt offset: オフセット値 limit: 取得件数
WSDL Output	return (xs:string)
Output Description	エントリの詳細情報一覧（XML形式）
Sample Code	try { jp.jcggdb.webservice.GGDBStub stub = new jp.jcggdb.webservice.GGDBStub(); jp.jcggdb.webservice.GGDBStub.SearchDesignation req = new jp.jcggdb.webservice.GGDBStub.SearchDesignation(); req.setEnzyme("a"); req.setType("list"); req.setOffset(0); req.setLimit(5); jp.jcggdb.webservice.GGDBStub.SearchDesignationResponse res = stub.searchDesignation(req); System.out.println(res.get_return()); } catch (Throwable e) { e.printStackTrace(); }

REST

Operation	search
URI Convention	/search/query+designation[offset,[limit]][/type]
Input	query, type, offset, limit
Input Description	query: 検索したいキーワード (enzyme) type: list or cnt offset: オフセット値 limit: 取得件数
Output	xml
Output Description	エントリの詳細情報一覧（XML形式）
Sample URI	http://riodb.ibase.aist.go.jp/rcmg/ws/ggdb/search/alpha1,3-N-acetylgalactosaminytransferase+designation/ http://riodb.ibase.aist.go.jp/rcmg/ws/ggdb/search/alpha1,3-N-acetylgalactosaminytransferase+designation/list http://riodb.ibase.aist.go.jp/rcmg/ws/ggdb/search/alpha1,3-N-acetylgalactosaminytransferase+designation/cnt http://riodb.ibase.aist.go.jp/rcmg/ws/ggdb/search/alpha1,3-N-acetylgalactosaminytransferase+designation/1,5 http://riodb.ibase.aist.go.jp/rcmg/ws/ggdb/search/alpha1,3-N-acetylgalactosaminytransferase+designation/1 http://riodb.ibase.aist.go.jp/rcmg/ws/ggdb/search/alpha1,3-N-acetylgalactosaminytransferase+designation/1,5/list http://riodb.ibase.aist.go.jp/rcmg/ws/ggdb/search/alpha1,3-N-acetylgalactosaminytransferase+designation/1,5/cnt

searchAcceptor
REST Operation	/search/query+acceptor[offset,[limit]][/type]
SOAP Operation	searchAcceptor
Description	Acceptor情報を検索して、エントリ一覧を返す

SOAP

Operation	searchAcceptor
WSDL	http://riodb.ibase.aist.go.jp/rcmg/ws/ggdb/services/GGDB?wsdl
WSDL Input	acceptor (xs:string), type (xs:string), offset (xs:Integer), limit (xs:Integer)
Input Description	acceptor: 検索したいキーワード(acceptor) type: list or cnt offset: オフセット値 limit: 取得件数
WSDL Output	return (xs:string)
Output Description	エントリの詳細情報一覧（XML形式）
Sample Code	try { jp.jcggdb.webservice.GGDBStub stub = new jp.jcggdb.webservice.GGDBStub(); jp.jcggdb.webservice.GGDBStub.SearchAcceptor req = new jp.jcggdb.webservice.GGDBStub.SearchAcceptor(); req.setAcceptor("aa"); req.setType("list"); req.setOffset(0); req.setLimit(5); jp.jcggdb.webservice.GGDBStub.SearchAcceptorResponse res = stub.searchAcceptor(req); System.out.println(res.get_return()); } catch (Throwable e) { e.printStackTrace(); }

REST

Operation	search
URI Convention	/search/query+acceptor [offset,[limit]][/type]
Input	query, type, offset, limit
Input Description	query: 検索したいキーワード (acceptor) type: list or cnt offset: オフセット値 limit: 取得件数
Output	xml
Output Description	エントリの詳細情報一覧（XML形式）
Sample URI	http://riodb.ibase.aist.go.jp/rcmg/ws/ggdb/search/O-glycan Synthesis+acceptor/ http://riodb.ibase.aist.go.jp/rcmg/ws/ggdb/search/O-glycan Synthesis+acceptor/list http://riodb.ibase.aist.go.jp/rcmg/ws/ggdb/search/O-glycan Synthesis+acceptor/cnt http://riodb.ibase.aist.go.jp/rcmg/ws/ggdb/search/O-glycan Synthesis+acceptor/1,5 http://riodb.ibase.aist.go.jp/rcmg/ws/ggdb/search/O-glycan Synthesis+acceptor/1 http://riodb.ibase.aist.go.jp/rcmg/ws/ggdb/search/O-glycan Synthesis+acceptor/1,5/list http://riodb.ibase.aist.go.jp/rcmg/ws/ggdb/search/O-glycan Synthesis+acceptor/1,5/cnt

searchExpression
REST Operation	/search/query+expression[offset,[limit]][/type]
SOAP Operation	searchExpression
Description	Expression情報を検索して、エントリ一覧を返す

SOAP

Operation	searchExpression
WSDL	http://riodb.ibase.aist.go.jp/rcmg/ws/ggdb/services/GGDB?wsdl
WSDL Input	specific (xs:string), type (xs:string), offset (xs:Integer), limit (xs:Integer)
Input Description	specific: 検索したいキーワード(specific) type: list or cnt offset: オフセット値 limit: 取得件数
WSDL Output	return (xs:string)
Output Description	エントリの詳細情報一覧（XML形式）
Sample Code	try { jp.jcggdb.webservice.GGDBStub stub = new jp.jcggdb.webservice.GGDBStub(); jp.jcggdb.webservice.GGDBStub.SearchExpression req = new jp.jcggdb.webservice.GGDBStub.SearchExpression(); req.setSpecific("a"); req.setType("list"); req.setOffset(0); req.setLimit(5); jp.jcggdb.webservice.GGDBStub.SearchExpressionResponse res = stub.searchExpression(req); System.out.println(res.get_return()); } catch (Throwable e) { e.printStackTrace(); }

REST

Operation	search
URI Convention	/search/query+expression[offset,[limit]][/type]
Input	query, type, offset, limit
Input Description	query: 検索したいキーワード (specific) type: list or cnt offset: オフセット値 limit: 取得件数
Output	xml
Output Description	エントリの詳細情報一覧（XML形式）
Sample URI	http://riodb.ibase.aist.go.jp/rcmg/ws/ggdb/search/spleen+expression/ http://riodb.ibase.aist.go.jp/rcmg/ws/ggdb/search/spleen+expression/list http://riodb.ibase.aist.go.jp/rcmg/ws/ggdb/search/spleen+expression/cnt http://riodb.ibase.aist.go.jp/rcmg/ws/ggdb/search/spleen+expression/1,5 http://riodb.ibase.aist.go.jp/rcmg/ws/ggdb/search/spleen+expression/1 http://riodb.ibase.aist.go.jp/rcmg/ws/ggdb/search/spleen+expression/1,5/list http://riodb.ibase.aist.go.jp/rcmg/ws/ggdb/search/spleen+expression/1,5/cnt

searchPMID
REST Operation	/search/query+PMID[offset,[limit]][/type]
SOAP Operation	searchPMID
Description	PUBMED_ID情報を検索して、エントリ一覧を返す

SOAP

Operation	searchPMID
WSDL	http://riodb.ibase.aist.go.jp/rcmg/ws/ggdb/services/GGDB?wsdl
WSDL Input	PMID (xs:string), type (xs:string), offset (xs:Integer), limit (xs:Integer)
Input Description	PMID: 検索したいキーワード(PMID) type: list or cnt offset: オフセット値 limit: 取得件数
WSDL Output	return (xs:string)
Output Description	エントリの詳細情報一覧（XML形式）
Sample Code	try { jp.jcggdb.webservice.GGDBStub stub = new jp.jcggdb.webservice.GGDBStub(); jp.jcggdb.webservice.GGDBStub.SearchPMID req = new jp.jcggdb.webservice.GGDBStub.SearchPMID(); req.setPubmed_id("8182079"); req.setType("list"); req.setOffset(0); req.setLimit(5); jp.jcggdb.webservice.GGDBStub.SearchPMIDResponse res = stub.searchPMID(req); System.err.println(res.get_return()); } catch (Throwable e) { e.printStackTrace(); }

REST

Operation	search
URI Convention	/search/query+PMID[offset,[limit]][/type]
Input	query, type, offset, limit
Input Description	query: 検索したいキーワード (PMID) type: list or cnt offset: オフセット値 limit: 取得件数
Output	xml
Output Description	エントリの詳細情報一覧（XML形式）
Sample URI	http://riodb.ibase.aist.go.jp/rcmg/ws/ggdb/search/11278338+PMID/ http://riodb.ibase.aist.go.jp/rcmg/ws/ggdb/search/11278338+PMID/list http://riodb.ibase.aist.go.jp/rcmg/ws/ggdb/search/11278338+PMID/cnt http://riodb.ibase.aist.go.jp/rcmg/ws/ggdb/search/11278338+PMID/1,5 http://riodb.ibase.aist.go.jp/rcmg/ws/ggdb/search/11278338+PMID/1 http://riodb.ibase.aist.go.jp/rcmg/ws/ggdb/search/11278338+PMID/1,5/list http://riodb.ibase.aist.go.jp/rcmg/ws/ggdb/search/11278338+PMID/1,5/cnt

getXmlEntry
REST Operation	/entry/symbol[.xml]
SOAP Operation	getXmlEntry
Description	GGDBエントリの詳細情報をXML形式で返す

SOAP

Operation	getXmlEntry
WSDL	http://riodb.ibase.aist.go.jp/rcmg/ws/ggdb/services/GGDB?wsdl
WSDL Input	symbol (xs:string)
Input Description	任意のSymbol (カンマ区切りで複数エントリ取得可: FUT1,FUT2,FUT3…)
WSDL Output	return (xs:string)
Output Description	エントリの詳細情報一覧（XML形式）
Sample Code	try { jp.jcggdb.webservice.GGDBStub stub = new jp.jcggdb.webservice.GGDBStub(); jp.jcggdb.webservice.GGDBStub.GetXmlEntry req = new jp.jcggdb.webservice.GGDBStub.GetXmlEntry(); req.setSymbol("FUT1"); jp.jcggdb.webservice.GGDBStub.GetXmlEntryResponse res = stub.getXmlEntry(req); System.out.println(res.get_return()); } catch (Throwable e) { e.printStackTrace(); }

REST

Operation	entry
URI Convention	entry/symbol[.xml]
Input	symbol (カンマ区切りで複数エントリ取得可: FUT1,FUT2,FUT3…)
Input Description	任意のSymbol
Output	xml
Output Description	エントリの詳細情報（XML形式）
Sample URI	http://riodb.ibase.aist.go.jp/rcmg/ws/ggdb/entry/FUT1 http://riodb.ibase.aist.go.jp/rcmg/ws/ggdb/entry/FUT1.xml

getTextEntry
REST Operation	/entry/symbol.text
SOAP Operation	getTextEntry
Description	GGDBエントリの詳細情報をTEXT形式で返す

SOAP

Operation	getTextEntry
WSDL	http://riodb.ibase.aist.go.jp/rcmg/ws/ggdb/services/GGDB?wsdl
WSDL Input	symbol (xs:string)
Input Description	任意のSymbol (カンマ区切りで複数エントリ取得可: FUT1,FUT2,FUT3…)
WSDL Output	return (xs:string)
Output Description	エントリの詳細情報一覧（XML形式）
Sample Code	try { jp.jcggdb.webservice.GGDBStub stub = new jp.jcggdb.webservice.GGDBStub(); jp.jcggdb.webservice.GGDBStub.GetTextEntry req = new jp.jcggdb.webservice.GGDBStub.GetTextEntry(); req.setSymbol("FUT1"); jp.jcggdb.webservice.GGDBStub.GetTextEntryResponse res = stub.getTextEntry(req); System.out.println(res.get_return()); } catch (Throwable e) { e.printStackTrace(); }

REST

Operation	entry
URI Convention	entry/symbol.text
Input	symbol (カンマ区切りで複数エントリ取得可: FUT1,FUT2,FUT3…)
Input Description	任意のSymbol
Output	xml
Output Description	エントリの詳細情報（XML形式）
Sample URI	http://riodb.ibase.aist.go.jp/rcmg/ws/ggdb/entry/FUT1.text

getDraftEntry
REST Operation	/entry/symbol.draft
SOAP Operation	getDraftEntry
Description	GGDBエントリの詳細情報をドラフトテキスト形式で返す

SOAP

Operation	getDraftEntry
WSDL	http://riodb.ibase.aist.go.jp/rcmg/ws/ggdb/services/GGDB?wsdl
WSDL Input	symbol (xs:string)
Input Description	任意のSymbol (カンマ区切りで複数エントリ取得可: FUT1,FUT2,FUT3…)
WSDL Output	return (xs:string)
Output Description	エントリの詳細情報一覧（ドラフトテキスト形式）
Sample Code	try { jp.jcggdb.webservice.GGDBStub stub = new jp.jcggdb.webservice.GGDBStub(); jp.jcggdb.webservice.GGDBStub.GetTextEntry req = new jp.jcggdb.webservice.GGDBStub.GetTextEntry(); req.setSymbol("FUT1"); jp.jcggdb.webservice.GGDBStub.GetTextEntryResponse res = stub.getTextEntry(req); System.out.println(res.get_return()); } catch (Throwable e) { e.printStackTrace(); }

REST

Operation	entry
URI Convention	entry/symbol.draft
Input	symbol (カンマ区切りで複数エントリ取得可: FUT1,FUT2,FUT3…)
Input Description	任意のSymbol
Output	xml
Output Description	エントリの詳細情報（ドラフトテキスト形式）
Sample URI	http://riodb.ibase.aist.go.jp/rcmg/ws/ggdb/entry/FUT1.draft

getDesignation
REST Operation	entry/symbol/designation
SOAP Operation	getDesignation
Description	任意のDesignation情報を返す

SOAP

Operation	getDesignation
WSDL	http://riodb.ibase.aist.go.jp/rcmg/ws/ggdb/services/GGDB?wsdl
WSDL Input	symbol (xs:string)
Input Description	任意のSymbol (カンマ区切りで複数エントリ取得可: FUT1,FUT2,FUT3…)
WSDL Output	return (xs:string)
Output Description	エントリの詳細情報（XML形式）
Sample Code	try { jp.jcggdb.webservice.GGDBStub stub = new jp.jcggdb.webservice.GGDBStub(); jp.jcggdb.webservice.GGDBStub.GetDesignation req = new jp.jcggdb.webservice.GGDBStub.GetDesignation(); req.setSymbol("FUT1"); jp.jcggdb.webservice.GGDBStub.GetDesignationResponse res = stub.getDesignation(req); System.out.println(res.get_return()); } catch (Throwable e) { e.printStackTrace(); }

REST

Operation	entry
URI Convention	entry/symbol/designation
Input	symbol (カンマ区切りで複数エントリ取得可: FUT1,FUT2,FUT3…)
Input Description	任意のSymbol
Output	xml
Output Description	エントリの詳細情報（XML形式）
Sample URI	http://riodb.ibase.aist.go.jp/rcmg/ws/ggdb/entry/FUT1/designation

getExpression
REST Operation	entry/symbol/expression
SOAP Operation	getExpression
Description	任意のExpression情報を返す

SOAP

Operation	getExpression
WSDL	http://riodb.ibase.aist.go.jp/rcmg/ws/ggdb/services/GGDB?wsdl
WSDL Input	symbol (xs:string)
Input Description	任意のSymbol (カンマ区切りで複数エントリ取得可: FUT1,FUT2,FUT3…)
WSDL Output	return (xs:string)
Output Description	エントリの詳細情報（XML形式）
Sample Code	try { jp.jcggdb.webservice.GGDBStub stub = new jp.jcggdb.webservice.GGDBStub(); jp.jcggdb.webservice.GGDBStub.GetExpression req = new jp.jcggdb.webservice.GGDBStub.GetExpression(); req.setSymbol("FUT1"); jp.jcggdb.webservice.GGDBStub.GetExpressionResponse res = stub.getExpression(req); System.out.println(res.get_return()); } catch (Throwable e) { e.printStackTrace(); }

REST

Operation	entry
URI Convention	entry/symbol/expression
Input	symbol (カンマ区切りで複数エントリ取得可: FUT1,FUT2,FUT3…)
Input Description	任意のSymbol
Output	xml
Output Description	エントリの詳細情報（XML形式）
Sample URI	http://riodb.ibase.aist.go.jp/rcmg/ws/ggdb/entry/FUT1/expression

getAcceptor
REST Operation	entry/symbol/acceptor
SOAP Operation	getAcceptor
Description	任意のAcceptor情報を返す

SOAP

Operation	getAcceptor
WSDL	http://riodb.ibase.aist.go.jp/rcmg/ws/ggdb/services/GGDB?wsdl
WSDL Input	symbol (xs:string)
Input Description	任意のSymbol (カンマ区切りで複数エントリ取得可: FUT1,FUT2,FUT3…)
WSDL Output	return (xs:string)
Output Description	エントリの詳細情報（XML形式）
Sample Code	try { jp.jcggdb.webservice.GGDBStub stub = new jp.jcggdb.webservice.GGDBStub(); jp.jcggdb.webservice.GGDBStub.GetAcceptor req = new jp.jcggdb.webservice.GGDBStub.GetAcceptor(); req.setSymbol("FUT1"); jp.jcggdb.webservice.GGDBStub.GetAcceptorResponse res = stub.getAcceptor(req); System.out.println(res.get_return()); } catch (Throwable e) { e.printStackTrace(); }

REST

Operation	entry
URI Convention	entry/symbol/acceptor
Input	symbol (カンマ区切りで複数エントリ取得可: FUT1,FUT2,FUT3…)
Input Description	任意のSymbol
Output	xml
Output Description	エントリの詳細情報（XML形式）
Sample URI	http://riodb.ibase.aist.go.jp/rcmg/ws/ggdb/entry/FUT1/acceptor

getPMID
REST Operation	entry/symbol/PMID
SOAP Operation	getPMID
Description	任意のPMID情報を返す

SOAP

Operation	getPMID
WSDL	http://riodb.ibase.aist.go.jp/rcmg/ws/ggdb/services/GGDB?wsdl
WSDL Input	symbol (xs:string)
Input Description	任意のSymbol (カンマ区切りで複数エントリ取得可: FUT1,FUT2,FUT3…)
WSDL Output	return (xs:string)
Output Description	エントリの詳細情報（XML形式）
Sample Code	try { jp.jcggdb.webservice.GGDBStub stub = new jp.jcggdb.webservice.GGDBStub(); jp.jcggdb.webservice.GGDBStub.GetPMID req = new jp.jcggdb.webservice.GGDBStub.GetPMID(); req.setSymbol("FUT1"); jp.jcggdb.webservice.GGDBStub.GetPMIDResponse res = stub.getPMID(req); System.out.println(res.get_return()); } catch (Throwable e) { e.printStackTrace(); }

REST

Operation	entry
URI Convention	entry/symbol/PMID
Input	symbol (カンマ区切りで複数エントリ取得可: FUT1,FUT2,FUT3…)
Input Description	任意のSymbol
Output	xml
Output Description	エントリの詳細情報（XML形式）
Sample URI	http://riodb.ibase.aist.go.jp/rcmg/ws/ggdb/entry/FUT1/PMID

getIdList
REST Operation	getIdList[/type[.format]]
SOAP Operation	getIdList
Description	GeneNameとmRNAの一覧を返す

SOAP

Operation	getIdList
WSDL	http://riodb.ibase.aist.go.jp/rcmg/ws/ggdb/services/GGDB?wsdl
WSDL Input	type (xs:string), format (xs:string)
Input Description	type: list or cnt format: xml or text
WSDL Output	return (xs:string)
Output Description	GeneNameとmRNAの一覧
Sample Code	try { jp.jcggdb.webservice.GGDBStub stub = new jp.jcggdb.webservice.GGDBStub(); jp.jcggdb.webservice.GGDBStub.GetIdList req = new jp.jcggdb.webservice.GGDBStub.GetIdList(); req.setFormat("xml"); req.setType("list"); jp.jcggdb.webservice.GGDBStub.GetIdListResponse res = stub.getIdList(req); System.out.println(res.get_return()); } catch (Throwable e) { e.printStackTrace(); }

REST

Operation	getIdList
URI Convention	getIdList[/type[.format]]
Input	type, format
Input Description	type: list or cnt format: xml or text
Output	xml
Output Description	GeneNameとmRNAの一覧
Sample URI	http://riodb.ibase.aist.go.jp/rcmg/ws/ggdb/getIdList http://riodb.ibase.aist.go.jp/rcmg/ws/ggdb/getIdList/list http://riodb.ibase.aist.go.jp/rcmg/ws/ggdb/getIdList/list.text http://riodb.ibase.aist.go.jp/rcmg/ws/ggdb/getIdList/cnt http://riodb.ibase.aist.go.jp/rcmg/ws/ggdb/getIdList/cnt.text

5. 共通仕様

5.1. 処理時の結果が0件の場合

Search及びEntry処理時に結果が0件の場合、空エントリを返す。RESTは、ステータスが404になる。

5.2. 実行中エラーの処理

実行時にエラーが発生した場合、RESTは404ステータスを返し、エラー画面が表示される。

5.3. SOAP Fault

SOAPはSOAP Faultを返すが、エラーの処理については各クライアントに任せられる。

SOAP Input 正常時

<?xml version='1.0' encoding='utf-8'?>
<soap:Envelope xmlns:soap="http://schemas.xmlsoap.org/soap/envelope/"
        xmlns:typens=http://webservice.jcggdb.jp
        xmlns:xsi=http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance
        xmlns:soapenc="http://schemas.xmlsoap.org/soap/encoding/"
        xmlns:wsdl="http://schemas.xmlsoap.org/wsdl/"
        xmlns:xsd="http://www.w3.org/2001/XMLSchema"
        soap:encodingStyle="http://schemas.xmlsoap.org/soap/encoding/">
<soap:Body>
  <typens:getIdList>
   <format xsi:type="xsd:string">text</format>
   <type xsi:type="xsd:string">list</type>
  </typens:getIdList>
</soap:Body>
</soap:Envelope>

SOAP Output 正常時

<?xml version='1.0' encoding='utf-8'?>
<soapenv:Envelope xmlns:soapenv="http://schemas.xmlsoap.org/soap/envelope/">
<soapenv:Body>
  <ns:getIdListResponse xmlns:ns="http://webservice.jcggdb.jp">
   <ns:return>
    FUT1 NM_000148
    FUT2 NM_000511
    …
    SLC35D2 NM_007001
    beta3Glc-T NM_194318
   </ns:return>
  </ns:getIdListResponse>
</soapenv:Body>
</soapenv:Envelope>

SOAP Input エラー時
※ Requestのパラメータが不足

SOAP Output エラー時
※ SOAP Faultを返す

<?xml version='1.0' encoding='utf-8'?>
<soapenv:Envelope xmlns:soapenv="http://schemas.xmlsoap.org/soap/envelope/">
<soapenv:Body>
  <soapenv:Fault>
   <faultcode>soapenv:Server</faultcode>
   <faultstring>
    Exception occurred while trying to invoke service method getIdList
   </faultstring>
   <detail />
  </soapenv:Fault>
</soapenv:Body>
</soapenv:Envelope>